Theo cáo trạng, Công ty CP khí hóa lỏng Đồng Tháp (DGC) với ngành nghề kinh doanh khí hóa lỏng, vốn điều lệ 60 tỉ đồng. Trong đó, Công ty CP thương mại dầu khí Đồng Tháp (PETIMEX) vốn góp 20,4 tỉ đồng, chiếm tỷ lệ 35%. HĐQT DGC có 6 thành viên, do Khôi là Chủ tịch và ông Đinh Văn Hoàng, Giám đốc DGC là 2 thành viên đại diện phần vốn góp của PETIMEX tại DGC. Mỗi tháng, Khôi hưởng mức lương 50 triệu đồng.
Ngày 25.12.2021, HĐQT DGC họp và ra Nghị quyết đề xuất tăng mức lương chi cho Chủ tịch HĐQT vào tháng 1.2022 là 500 triệu đồng/tháng. Cùng ngày, DGC cũng tổ chức đại hội cổ đông thường niên năm 2020 (do năm 2021 ảnh hưởng dịch Covid-19 nên công ty không họp đúng thời gian) để ra các nghị quyết, tờ trình phân phối lợi nhuận năm 2020; kế hoạch phân phối lợi nhuận năm 2021, trong đó có kế hoạch chi lương cho Chủ tịch HĐQT vẫn là 50 triệu đồng/tháng. Trong khi đại hội cổ đông công ty DGC không xác định mức thưởng và không chi lương năm 2021 cho Chủ tịch HĐQT.
Đến ngày 17.1.2022, Khôi không tổ chức hội nghị mà phát phiếu lấy ý kiến của HĐQT để ra Nghị quyết thống nhất mức chi thưởng cho Chủ tịch HĐQT DGC là 3,5 tỉ đồng, chiếm đến 90,98% lợi nhuận còn lại chưa phân phối năm 2021 của DGC.
Đến ngày 19.1.2022, Khôi và kế toán trưởng ký duyệt 2 ủy nhiệm chi lương tháng 1.2022 là 500 triệu đồng và chi thưởng năm 2021 cho Khôi 3,5 tỉ đồng. Sau đó, số tiền 4 tỉ đồng này được chuyển vào tài khoản của Khôi. Nhận tiền xong, Khôi chuyển hết vào tài khoản của vợ mình.
Ngày 15.7.2022, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Đồng Tháp ra quyết định khởi tố vụ án tham ô tài sản xảy ra tại DGC để điều tra. Sau khi ngành chức năng khởi tố vụ án, ngày 20.7.2022 Khôi chuyển trả cho DGC toàn bộ số tiền lương, thưởng để khắc phục hậu quả.
Đến ngày 22.7, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Đồng Tháp bắt khẩn cấp Khôi; đồng thời khám xét nhà và nơi làm việc để điều tra làm rõ.
Theo Viện KSND tỉnh Đồng Tháp, với vai trò Chủ tịch HĐQT, người đại diện pháp luật, chủ tài khoản của DGC, bị cáo Khôi đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn và quy định về việc chi lương, thưởng đối với hình thức hoạt động của công ty cổ phần. Khôi đã chỉ đạo cán bộ cấp dưới làm thủ tục ký duyệt ủy nhiệm chi để chi lương, thưởng cho bản thân không đúng quy định, chiếm đoạt của công ty số tiền 3,95 tỉ đồng (do trừ đi 50 triệu đồng tiền lương tháng Khôi được hưởng theo quy định).
Tại tòa, đại diện Viện KSND tỉnh Đồng Tháp giữ quyền công tố đã luận tội và đề nghị tuyên phạt Lê Trung Nguyên Khôi mức án từ 16-18 năm tù. Qua 1 ngày xét xử, TAND tỉnh Đồng Tháp quyết định nghị án kéo dài và sẽ tuyên án vào ngày 23.5.